Marmara denizinde ortaya çıkan müsilaj; biyolojik ve kimyasal birçok koşulun bir araya gelmesiyle oluşan, fitoplankton olarak adlandırılan bitkisel canlıların aşırı çoğalması, deniz sıcaklığının yükselmesi ve buna bağlı olarak bakteriyel aktivitelerin artmasıyla oluşan sümüksü, yapışkan bir yapı.

Müsilajın Marmara'da artış göstermesinin  üç temel sebebi olduğu düşünülüyor:

-Müsilajın oluşabilmesi için azot-fosfor gibi organizmaları besleyen maddelere ihtiyaç var. Bunlar denize verilen atıklardan yoğun şekilde sağlanıyor. 

- İklim değişikliğine de bağlık olarak denizde yaşanan durgunluk

-Marmara Deniz'inde bir süredir sıcaklığın normalde olması gerekenden 2-3 derece yüksek olması.