GATA kaynakları, doktorların memnuniyetsizliğini iki sebebe bağlıyor. Birincisi büyük özel hastanelerden gelen cazip teklifler. Zaten emeklilik yaşı gelen profesör ve doçent statüsündeki doktorlar ekonomik durumu da göz önünde bulundurarak gelen tekliflere sıcak bakıyor. Kaynaklardan edinilen bilgiye göre ikinci sebep, bu yılki atamalarda hayata geçirilmesi düşünülen `doktor komutan` projesi.

Uzun yıllardır ordu komutanlıklarından doktor olmayan kişiler GATA`ya komutan olarak atanıyordu. Bunun gerekçesi olarak da doktorların komuta sorumluluğundan sıyrılarak kendi işleriyle daha etkin ilgilenebilmesi olarak gösteriliyordu. Ancak bu durum hasta sağlığıyla ilgili önemli konularda karar alınırken sıkıntılara yol açıyordu. Bu yüzden İstanbul`da bulunan Haydarpaşa GATA`da böyle önemli bir değişikliğe gidileceği ifade ediliyordu. Ayrıca, GATA Komutanlığı`nın da tümgeneral yerine tuğgeneral seviyesine düşürülmesi planlanıyordu. Ancak bu proje bir yıl ertelendi.